GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液

GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液是专为荧光法循环测序反应设计的核心辅助试剂,隶属于 GeticoDye Terminator 系列测序体系,主要功能是为测序反应提供稳定、优化的离子环境与 pH 条件,同时可用于稀释 GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix(2.5X 浓度),使其在测序反应中达到 1X 终浓度,最终保障 Sanger 测序(一代测序)结果的准确性、重复性与长读长性能。该缓冲液适配单链 DNA、双链 DNA、PCR 片段、BAC 克隆等多种类型的 DNA 模板,可与 Minor Variant Finder 软件配合使用,实现低至 5% 频率的样本变异检测,广泛适用于基础科研、分子诊断前期研究等场景的基因序列分析。

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210101

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21010228ml16800.00

210103

233ml

138000.00


GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液产品介绍


一、产品定位与核心功能


GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液是专为荧光法循环测序反应设计的核心辅助试剂,隶属于 GeticoDye Terminator 系列测序体系,主要功能是为测序反应提供稳定、优化的离子环境与 pH 条件,同时可用于稀释 GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix(2.5X 浓度),使其在测序反应中达到 1X 终浓度,最终保障 Sanger 测序(一代测序)结果的准确性、重复性与长读长性能。

该缓冲液适配单链 DNA、双链 DNA、PCR 片段、BAC 克隆等多种类型的 DNA 模板,可与 Minor Variant Finder 软件配合使用,实现低至 5% 频率的样本变异检测,广泛适用于基础科研、分子诊断前期研究等场景的基因序列分析。


二、适配仪器与兼容性


(一)核心适配测序仪


该缓冲液作为一代测序核心辅助试剂,可完美匹配多款主流一代测序仪,尤其针对 3730/3730xl DNA Analyzer(3730XL 测序仪)具备优化的兼容性,同时支持以下仪器型号:

• SeqStudio™ Genetic Analyzer

• SeqStudio™ Flex Series Genetic Analyzer

• 3500/3500xL Genetic Analyzer

在搭配上述仪器使用时,需根据仪器类型选择对应的电泳模块与 mobility 文件(如适配 3730xl 测序仪时,推荐使用 KB_3730_POP7_BDTv3.mob 等专用 mobility 文件),并结合仪器操作指南完成测序流程,确保数据质量。


(二)兼容热循环仪


测序反应的热循环步骤可适配 Applied Biosystems™ 系列专用热循环仪,也可兼容其他品牌热循环仪(需根据仪器特性优化循环条件),推荐适配型号包括:

• GeneAmp™ PCR System 9700 Dual 96-Well

• GeneAmp™ PCR System 9700 Dual 384-Well

• Veriti™ Fast 96‑Well Thermal Cycler

• Veriti™ 384‑Well Thermal Cycler

使用非推荐热循环仪时,需注意控制升温速率(建议 ≤1°C / 秒),避免因升温过快导致测序数据噪声增加。


三、产品规格与存储要求


(一)包装规格


该缓冲液通常作为 GeticoDye Terminator v3.1 循环测序试剂盒的组成部分,可以单独销售。


(二)存储条件


• 存储温度:4°C 冷藏保存,无需冷冻;

• 避光要求:无需额外避光,但需避免与试剂盒中含荧光染料的组分(如 Ready Reaction Mix)长期共同暴露于强光环境;

• 冻融限制:避免反复冻融,建议根据单次使用量分装为小体积(如 100 μL / 管),分装后仍需 4°C 保存,分装后使用周期不超过 1 个月;

• 使用状态:使用前需在室温或冰上自然解冻,解冻后轻轻涡旋混匀(2-3 秒),并短暂离心(2-3 秒)使液体集中于管底,全程避免加热。


四、使用方法与操作要点


(一)核心应用场景:稀释测序反应体系


该缓冲液的核心用途是稀释 GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix(2.5X),以 20 μL 终体积的 0.5X 稀释反应为例,典型反应体系配置如下:

 

组分

体积(20 μL 反应)

说明

GeticoDye Terminator 3.1 Ready Reaction Mix(2.5X)

4 μL

提供测序所需的荧光终止子与 DNA 聚合酶

GeticoDye Terminator v1.1 & v3.1 5X 测序缓冲液

2 μL

稀释反应体系至 1X 终浓度

引物(3.2 μM,如 -21 M13 对照引物)

2 μL(3.2 pmol)

若使用 0.8 pmol/μL 对照引物,需加 8 μL

DNA 模板

2 μL

参考模板用量标准(如双链 DNA 150-300 ng/μL)

无酶无 RNase 水

10 μL

补足体积至 20 μL,需根据模板 / 引物实际体积调整

注:缓冲液稀释比例需严格按照公式计算(缓冲液体积 = 0.5×(总反应体积 / 2.5) - Ready Reaction Mix 体积),未优化的稀释比例可能导致测序质量下降,不建议随意调整。


(二)操作注意事项


1. 试剂混用禁忌:仅可与 GeticoDye Terminator v1.1 或 v3.1 系列的 Ready Reaction Mix 搭配,不可用于其他品牌或版本的测序试剂;

2. 污染防控:使用专用移液器与无酶无 RNase 耗材,避免交叉污染;缓冲液管口避免接触反应管或其他试剂,使用后及时盖紧管盖;

3. 反应后处理:含该缓冲液的测序反应完成后,需通过 BigDye XTerminator™ 纯化试剂盒或乙醇 / EDTA 沉淀法纯化(去除未结合的染料终止子与盐类),再进行 capillary electrophoresis(毛细管电泳);

4. 对照实验:每次实验建议设置含 pREF-BDT™ 对照 DNA(200 ng/μL)的对照反应,以验证缓冲液活性与测序体系有效性。


五、产品优势与 troubleshooting 支持


(一)核心优势


1. 性能稳定性:采用高纯度原料与严格的生产质控,批次间差异小,可保障测序反应的离子浓度与 pH 稳定,提升数据重复性(读长可最大化至仪器上限);

2. 适配灵活性:同时兼容 v1.1 与 v3.1 两个版本的 GeticoDye Terminator 测序体系,无需为不同版本试剂单独采购缓冲液;

3. 操作便捷性:预混 5X 浓度设计,无需手动配制缓冲液组分,直接按比例添加即可,简化实验流程;

4. 仪器兼容性广:针对 3730XL 等主流一代测序仪进行优化,可直接适配仪器默认的测序模块与数据分析参数,降低方法开发难度。


(二)常见问题与解决方案


若使用过程中出现测序数据异常,可结合以下与缓冲液相关的排查方向解决:


常见问题

可能原因(与缓冲液相关)

解决方案

信号强度低

缓冲液稀释比例错误;缓冲液反复冻融失效

重新核对稀释公式,使用未反复冻融的缓冲液重新实验

数据噪声高

缓冲液污染;缓冲液与其他试剂混合不均匀

更换新批次缓冲液,使用前充分涡旋混匀并短暂离心

5' 端测序质量差

缓冲液与 POP-7™ 聚合物搭配使用(v3.1 体系)

若需提升 5' 端质量,可搭配 POP-6™ 聚合物与 v1.1 体系使用



GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液常见问题(FAQ)

 

基础信息类

Q1:GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液的核心用途是什么?

A1:该缓冲液是荧光法循环测序反应的核心辅助试剂,主要用于两个关键场景:一是为 GeticoDye Terminator v1.1 或 v3.1 系列测序反应提供稳定的离子环境与 pH 条件,保障测序反应高效进行;二是稀释 GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix(2.5X 浓度),使其在测序体系中达到 1X 终浓度,最终确保 Sanger 测序(一代测序)结果的准确性、重复性与长读长性能。

Q2:该产品能否直接替代赛默飞的 BigDye™ Terminator v1.1 & v3.1 5X Sequencing Buffer?

A2:可以完全平替。从核心功能、适配体系、仪器兼容性到使用方法,GeticoDye Terminator v1.1 和 v3.1 5X 测序缓冲液均与赛默飞 BigDye™ Terminator v1.1 & v3.1 5X Sequencing Buffer 保持一致:

• 适配相同版本的测序体系(v1.1 和 v3.1 系列 Ready Reaction Mix);

• 兼容同款一代测序仪(如 3730XL、3500/3500xL、SeqStudio 系列等);

• 反应体系配置比例、稀释公式、存储条件完全通用,无需调整实验参数即可直接替换使用,且测序数据质量(读长、信号强度、重复性)与原产品无差异。

Q3:该缓冲液支持哪些类型的 DNA 模板和测序仪?

A3:在模板适配方面,可兼容单链 DNA、双链 DNA、PCR 片段(100 bp-2000+ bp)、BAC 克隆、黏粒等多种类型的 DNA 模板,满足基础科研与分子诊断前期研究的多样化需求;

在仪器适配方面,核心支持 3730/3730xl DNA Analyzer(3730XL 测序仪),同时兼容 SeqStudio™ Genetic Analyzer、SeqStudio™ Flex Series Genetic Analyzer、3500/3500xL Genetic Analyzer 等主流一代测序仪,适配仪器的电泳模块与 mobility 文件(如 3730XL 专用的 KB_3730_POP7_BDTv3.mob)与原赛默飞产品完全一致。

操作使用类

Q4:如何用该缓冲液稀释 GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix?有没有具体的计算方法和体系示例?

A4:需先通过公式计算缓冲液用量,再按比例配置体系,具体如下:

1. 稀释公式:缓冲液体积 = 0.5×(总反应体积 / 2.5) - GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix(2.5X)体积;

(原理:Ready Reaction Mix 为 2.5X 浓度,需稀释至 1X,缓冲液为 5X 浓度,通过公式可精准控制终浓度)


2. 体系示例(20 μL 终体积 0.5X 反应)

组分

体积

说明

无酶无 RNase 水

10 μL

补足体积,需根据模板 / 引物实际体积调整

5X 测序缓冲液

2 μL

按公式计算得出,确保终浓度适配

GeticoDye Terminator Ready Reaction Mix(2.5X)

4 μL

提供荧光终止子与 DNA 聚合酶

3.2 μM 引物

2 μL

若用 0.8 pmol/μL 对照引物,需加 8 μL

DNA 模板(如双链 DNA 150-300 ng/μL)

2 μL

按模板类型参考推荐用量

 

Q5:缓冲液解冻和使用过程中有哪些关键注意事项,避免影响实验结果?

A5:需重点关注 4 点:

1. 解冻方式:从 4°C 取出后,置于室温或冰上自然解冻,禁止加热(如温水浴),否则会破坏缓冲液中的稳定成分,导致离子浓度异常;

2. 混匀与离心:解冻后需轻轻涡旋 2-3 秒(避免剧烈涡旋产生气泡),再短暂离心(2-3 秒,3000-5000 rpm),使管壁残留液体集中于管底,确保用量精准;

3. 避免反复冻融:缓冲液反复冻融会导致性能下降,建议按单次使用量(如 100 μL / 管)分装,分装后仍 4°C 保存,1 个月内用完;

4. 污染防控:使用无酶无 RNase 耗材,缓冲液管口禁止接触反应管、吸头或其他试剂,操作时戴手套并定期更换,防止核酸酶或杂质污染。

Q6:用该缓冲液完成测序反应后,产物需要纯化吗?推荐什么纯化方法?

A6:必须纯化。测序反应后,体系中残留的未结合荧光终止子、盐类、多余引物等杂质会干扰毛细管电泳,导致峰形杂乱、信号噪声高,因此需通过纯化去除杂质;

推荐两种纯化方法:

1. BigDye XTerminator™ 纯化试剂盒:高效便捷,按 10 μL 纯化树脂 / 20 μL 反应液的比例加入,1400 rpm 振荡 30 分钟后离心,上清液直接上样,适合批量样品处理;

2. 乙醇 / EDTA 沉淀法:成本较低,向反应液中加 2 μL 3 M 乙酸钠(pH 5.2)+50 μL 冰乙醇,-20°C 静置 30 分钟后离心,70% 乙醇洗涤沉淀,晾干后用 Hi-Di™ 甲酰胺溶解,适合少量样品或预算有限的场景。

问题排查类

Q7:替换成该缓冲液后,测序信号强度明显降低,可能是什么原因?该怎么解决?

A7:主要有 3 类可能原因及对应解决方案:

1. 缓冲液用量错误:若未按公式计算,缓冲液用量不足会导致 Ready Reaction Mix 稀释不充分,信号生成减少;需重新核对公式,按总反应体积与 Ready Reaction Mix 体积精准计算缓冲液用量,重新配置体系;

2. 缓冲液反复冻融或过期:反复冻融会破坏缓冲液稳定性,过期会导致离子浓度失衡;需更换未反复冻融、在保质期内的缓冲液,且确保 4°C 储存条件合规;

3. 模板与缓冲液混合不均:缓冲液未充分混匀会导致局部反应环境异常;需在加入缓冲液后,轻轻涡旋 2-3 秒并短暂离心,确保各组分均匀接触。

Q8:用该缓冲液搭配 3730XL 测序仪时,5' 端测序质量差(前 20-30 bp 峰形模糊),该如何优化?

A8:该问题与缓冲液适配的测序体系和聚合物类型相关,可通过 2 种方式优化:

1. 调整体系与聚合物:若当前使用 v3.1 体系 + POP-7™ 聚合物,可更换为 v1.1 体系 + POP-6™ 聚合物(该组合对 5' 端分辨率更高),缓冲液无需更换,仅需同步调整 3730XL 测序仪的 mobility 文件(如 KB_3730_POP6_BDTv1.mob);

2. 优化热循环参数:适当降低退火温度(如从 50°C 降至 48°C),延长退火时间(从 5 秒增至 10 秒),确保引物与模板结合更稳定,减少 5' 端非特异性延伸产物,提升峰形清晰度。

Q9:同一批次实验中,部分样品测序数据正常,部分出现 “无信号”,排除模板和引物问题后,是否与缓冲液有关?

A9:可能与缓冲液的 “局部污染” 或 “分装不均” 有关,可按以下步骤排查:

1. 检查缓冲液分装过程:若手动分装时,吸头接触过其他试剂或污染的耗材,会导致部分分装管污染,仅影响使用该分装管的样品;需更换未污染的分装管,或直接使用未分装的原瓶缓冲液重新实验;

2. 验证缓冲液活性:用 pREF-BDT™ 对照 DNA(200 ng/μL)配置对照反应,若对照样品测序有信号,说明缓冲液整体活性正常,无信号样品可能是局部操作污染;若对照也无信号,需检查原瓶缓冲液是否受核酸酶污染(可通过琼脂糖凝胶电泳检测缓冲液是否含核酸酶降解条带),并更换新批次缓冲液。

储存与合规类

Q10:该缓冲液的储存条件和保质期是怎样的?开封后该如何保存?

A10:储存条件与保质期需分情况注意:

1. 未开封产品4°C 冷藏保存(禁止冷冻,0°C 以下会导致缓冲液结冰,解冻后离子浓度改变),未开封且储存合规时,保质期为产品标签所示的 18 个月;

2. 开封后产品:若未分装,需在 4°C 保存,且开封后 3 个月内用完;若按单次使用量分装(无酶无 RNase 离心管),分装后仍 4°C 保存,每管开封后需一次性用完,未开封的分装管保质期为 1 个月;

3. 储存禁忌:避免与含荧光染料的试剂(如 Ready Reaction Mix)长期共同暴露于强光环境,虽缓冲液本身无需避光,但强光可能通过试剂管间透射影响其他组分,间接干扰测序反应。

Q11:该缓冲液能否用于临床诊断实验?使用过程中需要注意哪些合规要求?

A11:该缓冲液仅用于科研用途,禁止用于临床诊断、人体样本检测(如疾病诊断、胎儿筛查等)或食品、药品质量检测等合规性要求严格的场景;

使用时需遵守 2 点合规要求:

1. 许可协议:产品受 “有限使用许可协议(Limited Use Label Licenses)” 约束,使用前需阅读并接受协议条款,禁止超出许可范围的商业使用或技术转让;

2. 废弃物处理:含该缓冲液的废弃反应液、耗材(吸头、离心管)需按实验室化学废弃物分类标准处置,不可随意排放或丢弃,避免环境污染;若涉及生物样本(如含病原体的 DNA 模板),需按生物安全等级要求进行高压灭菌后再处理。


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